Сродне душе Ерик и Шели су брутално убијене када их сустигну демони њене мрачне прошлости. Имајући прилику да спасе своју праву љубав жртвовањем себе, Ерик креће да тражи немилосрдну освету њиховим убицама, обилазећи светове живих и мртвих да би исправио погрешне ствари.
У далекој и магичној земљи живе брат и сестра које глад натера да напусте свој дом и крену у шуму у потрагу за храном. Деца након неколико дана лутања наилазе на велику кућу с обиљем хране и местом за спавање па им се то учини као идеално место за одмор. Убрзо, почињу да примећују чудне ствари око куће и необично понашање старице која у тој кући живи. Док су они сумњичави око свега што се око њих догађа, мрачне тајне почињу да избијају на површину.
The story follows Motoko Kusanagi, a highly skilled member of the military, whom upon meeting Daisuke Aramaki, a current chief of the Public Security Section 9, in less than desirable conditions struggles to clear her name whilst forming her own independent team with the highest priority under the sponsorship and guidance of the chief Aramaki himself. Ghost in the Shell: Arise is a re-imagining of Masamune Shirow's Ghost in the Shell.
